| Tabela 1. Distribuições SNPs de HLA-E em três grupos étnicos. | ||||||||||
| Euro-Caucasoid | Afro-Caribbean | Indo-Asian | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| SNP position | IMGT/ HLcDNA | Amino acid | Amino acid substitution | Base | n | % | n | % | n | % |
| 718C/T | 28 | -12 | s, f, p, lb, serine, phe, proline, leucine | C T |
446 0 |
100.0 0.0 |
120 0 |
100.0 0.0 |
104 0 |
100.0 0.0 |
| 719C/T | 29 | -12 | C T |
0 446 |
0.0 100.00 |
0 120 |
0.0 100.0 |
0 104 |
0.0 100.0 |
|
| 1081 C/G | 261 | 66 | R, R, serine, arginine | C G |
0 446 |
0.0 100.00 |
0 120 |
0.0 100.0 |
0 104 |
0.0 100.0 |
| 1114C/T | 294 | 77 | Synonymous | C T |
298 148 |
66.8 33.2 |
92 28 |
76.7c 23.3 |
89 15 |
85.6d 14.4 |
| 1130C/G | 310 | 83 | R, G, arginine, glycine | C G |
446 0 |
100.0 0.0 |
120 0 |
100.0 0.0 |
104 0 |
100.0 0.0 |
| 1446A/G | 382 | 107 | R, G, arginine, glycine | A G |
249 197 |
55.8 44.2 |
64 56 |
53.3 46.7 |
59 45 |
56.7 43.3 |
| 1455C/G | 392 | 131 | L, V, leucine, valine | C | 0 446 |
0.0 100.0 |
0 120 |
0.0 100.0 |
0 104 |
0.0 100.0 |
| 1596G/T | 532 | 157 | R, G, arginine, glycine | G A |
0 446 |
0.0 100.0 |
0 120 |
0.0 100.0 |
0 104 |
0.0 100.0 |
| 2747C/T | 938 | 292 | A, V, alanine, valine | C T |
0 446 |
0.0 100.0 |
0 120 |
0.0 100.0 |
0 104 |
0.0 100.0 |
AC, Afro-Caribenho; EC, Euro-Caucasóide; HLA, antígeno leucocitário humano; IA, Indo-Asiático; SNP, polimorfismo de único nucleotídeo. Frequência alélica de nove diferentes SNPs em três populações etnicamente diferentes, com a mudança de aminoácido causada por estes SNPs. As posições dos SNPs nas bases de dados Ensembl e IMGT/HLA são ilustradas. As diferenças estatísticas significativas das freqüências alélicas entre cada par das populações estudadas foram determinadas usando o teste de qui-quadrado.
b CTC: leucina, CCC: prolina, TCC: serina e TTC: fenilalanina.
c diferença estatística entre EC e AC, x2 = 4,28, p<0.05.
d diferença estatística entre EC e IA, x2 = 14.23, p<0.001.
Fonte: ANTOUN (2008).